K.V. prasanth实验室:发掘过程中的细胞增殖的lncrna的新作用

从左至右依次为:研究生秦屿豪和秦屿太阳,K.V. prasanth,细胞和发育生物学教授

该prasanth实验室最近在发表的论文 核酸研究题为“mir100宿主基因编码的lncrnas通过调制许及其靶mRNA之间的相互作用调节细胞周期”。

写的专一仙,微生物学研究生,伊姆莱实验室

如果人类基因组是一个蓝图,多年来蛋白被认为是开展细胞过程最终制造的产品。从历史上看,大多数研究实验室都集中在人类基因组中的蛋白质编码的两成。剩余的非编码区的作用已经开始只是在过去几十年来获得关注。

这些非编码区的大部分产生长非编码RNA或lncrnas。 “我们的实验室一直专注于lncrnas多年,说秦屿阳光下,研究生在实验室prasanth。 “虽然他们没有为蛋白质编码,它们在许多重要的生物学过程的重要作用,”她说。

“时间最长,lncrnas被认为是无功能序列,说:” prasanth,细胞和发育生物学系副教授。 “先进技术的发展,例如,新一代测序(NGS)帮助我们识别人体细胞的新lncrnas。现在我们知道,人类基因组包含超过20,000 lncrna基因。即使一半是功能性的,这是一个显著数。”

“Our lab is interested in studying the role of lncRNAs in cell cycle progression and their involvement in cancer progression. I am specifically interested in determining the role of a specific subset of lncRNAs that encode microRNAs in cell cycle progression,” said Sun. MicroRNAs are much smaller than lncRNAs (20-22 nucleotides vs >200 nucleotides). Therefore, the sequence of a single lncRNA can house the several microRNAs within its exons or intronic regions, earning these lncRNAs the name “microRNA host genes” or MIRHGs.

根据太阳“研究人员通常专注于microRNA和自己的角色,而完全忽略了mirhg玩微小RNA-独立功能的可能性,”她说。 “然而,我们的工作表明,lncrnas能独当一面它们编码的microRNA的。” prasanth补充说,“那是,在一般情况下,认为一旦微RNA出品,lncrna的其余部分被降解。这就是为什么,微小RNA独立的功能被忽略“。

这项新的研究主要集中在角色特定lncrna,mir100hg,细胞周期进程中。 “细胞表现出在其寿命不同的相。对于每个相,基因和蛋白质的人口中被表达不同。我们在看到mirhg,包括mir100hg是否显示基于细胞周期阶段的差异表达最初感兴趣,”解释prasanth。

“我们看到mir100hg期间G1期,当细胞正准备复制其DNA中高度表达。有趣的是,当我们在通过mir100hg编码微RNA,它们的水平保持不变,表明lncrna可能具有细胞周期中微小RNA-独立的角色,”说的太阳。

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因为实验室已解剖lncrna的功能的纸张的发现是新的。 “我们准备不小RNA成分全长mir100hg看着什么蛋白质可以与之交互。通过这样做,我们获得了关键洞察其在细胞周期中的作用”之称的太阳。

mir100hg与许,被已知作为RNA分子的转录后或翻译调节器,并且还示出调节细胞周期的蛋白质相互作用。 mir100hg-许相互作用促进许的到其RNA靶mRNA的结合,其中包括几个细胞周期调节的基因(细胞周期蛋白d),这表明mir100hg通过作为交互的支架调节许活性。

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“我在lncrnas兴趣从我的本科经验开始”之称的太阳。 “每lncrna候选人是新颖的。甚至特定lncrna如mir100hg可能通过调节蛋白的不同子集的活动执行在多种细胞类型或癌症的条件不同的功能。我也希望我的研究,有助于公众健康,并有助于找到治疗癌症的一种更好的方式。”

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