萨蒂什ķ奈尔

萨蒂什ķ奈尔

snair@illinois.edu

314C罗杰·亚当斯实验室
办公室:(217)333-0641
实验室:(217)333-2688
传真:(217)244-5858

邮件:生物化学系
417罗杰·亚当斯实验室B-4
600秒马修斯AVE
厄巴纳,IL 61801
视频访谈

中期头部和一.C gunsalus赋予生物化学教授
中心主任,生物物理学和生物学定量
子公司,化学系

研究课题

药物发现,酶学,宿主 - 病原体相互作用,膜生物学,微生物生理学,蛋白质结构

教育

理学士1989年布朗大学
博士1994年宾夕法尼亚大学
博士后。 1995-99洛克菲勒大学

天然产物的生物合成,细菌信号传导,x-射线晶体学

研究在奈尔实验室主要由小分子天然产品理解为细菌的调控奠定了基础。我们实验室采用经典的生物化学和微生物学技术,用生物物理方法的组合(特别是X射线晶体学)破译微生物如何利用小分子建立生态龛,并针对可能对有限资源的竞争拮抗物种的殖民战。这项研究重点是在这种互动的知识驱动,可以用来对抗致病细菌的生长天然产物的发现和开发的观念前提。

核糖体合成的肽类抗生素:一个主要的研究重点在我们的实验室是生物合成的酶,核糖体修改编码的肽产生大环的天然产品。我们特别重点了解机制两类这样的化合物的合成:羊毛硫抗生素和cyanobactins。用于天然产品的两个类,前体的遗传性质和修改/加工酶的模块化架构可以被利用,以产生具有改善的治疗性应用的新分子。我们的羊毛硫抗生素的工作,与范德反主动实验室(化学:UIUC)的合作,已瞄准参与生物合成的几种酶的表征。我们对cyanobactin与埃里克·施密特的工作,协作(药物化学:犹他州),专注于生产这些heterocyclized大环海洋天然产物的酶途径的结构与功能特征。

膦酸生物合成和工程:我们是基因组生物学(范德栋克:化学,梅特卡夫:微生物学和赵:化学工程)的研究所内的采矿微生物基因组主题的成员。与本主题的成员合作,我们专注于参与膦抗生素的生物合成的酶的表征,使用的结构数据重新编程这些酶,以产生新的化合物的目的。

细菌间和细胞内的通信:细菌可以利用小分子作为信号,并且我们的重点是阐明该过程基础的机制。在群体感应,细菌通过利用小分子诱导剂(通常酰基高丝氨酸内酯)坐标人口的增长。当人口密度超过某个阈值,这些自体诱导物结合其同源受体并激活多种基因的转录。第二类细胞间通信的时的在化学上从群体感应自体诱导物不同可扩散信号因子的作用的前提是。这些类化合物的激活充当各种信号转导途径的下游效应的产生或第二信使的降解,环状二鸟苷(或环状二GMP)。在理论上,因为每个这些途径的是由小分子调节,它们代表针对细菌生长的治疗性干预的理想靶点。

代表出版物

埃斯特拉达,页,森田,米。,豪,Y。,SCHMIDT,E.W. *和奈尔,S.K. *(2018)“的单个氨基酸改变开关在RIPP异戊二烯供体特异性异戊二烯基”Ĵ。上午。化学。 SOC。 DOI:10.1021 / jacs.8b05187。

ongpipattanakul,C,和奈尔,S.K. (2018)的acs CHEM“用于RIPP天然产物生物合成自催化骨干正methyltation分子基础”。生物。 DOI:10.1021 / acschembio.8b00668。

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一个湖,科根,D.P.,NAVO,C.D.,Jimenez的用途,例如,奈尔,S.K. *,和van der反主动,W.A. *(2018)“衬底辅助酶促形成赖氨酸丙氨酸的耐久霉素在”自然化学。生物。 DOI:10.1038 / s41589-018-0122-4。

科根,D.P.,哈德森,G.A。,张,克,波戈列洛夫,T.V.,范德华反主动,W.A.,米切尔,D.A.,和奈尔,S.K. (2017)“结构见解酶[4 + 2]氮杂环加成在硫肽抗生素的生物合成。” PROC。 nat'l ACAD。科幻美国。 114,12928-33。

chekan,J.R.,埃斯特拉达,页,covello,页,和奈尔,S.K. (2017年)“涉及石油化工科学研究院环肽的植物生物合成的macrocyclase的表征。” PROC。 nat'l ACAD。 SCI。 USA 114,6551-56。

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chekan,J.R.,和信,J.D.,宗角,马克西莫夫,M.O.,链接,A.J.,和奈尔,S.K. (2016)“套索肽肽酶的结构识别用于处理基板的螺纹的拓扑”。学家上午。化学。 SOC。 138,16452-58。

浩,Y。,刺穿,例如,鱼子,d。,森田,米。,McIntosh的,J.A.,瓦尔,V。,cheathem,T.E.,SCHMIDT,E.W.,和奈尔,S.K. (2016)“的肽异戊二烯基转移酶的广的底物选择性的分子基础”。 PROC。 nat'l ACAD。 SCI。美国113 14037-42。

特加,M.A.,豪,Y。,张,Q。,walke,M.C.,范德华反主动,W.A.,奈尔S.K. (2015)“结构和tRNA的依赖性羊毛硫抗生素脱水酶NISB的机制”。大自然517,509-12。

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